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组蛋白 H3 的表观遗传学“编写酶”和“去除酶”

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图表说明:

表观遗传调节蛋白可控制细胞分子组用来进行复制、转录、DNA 修复、重组和染色体分离所需的 DNA 序列可用性,从而在基因表达的调节中发挥关键作用。表观遗传调节包括被多类酶(称为“写入”和“擦除”蛋白)修饰的组蛋白氨基酸残基的翻译后修饰 (PTM)。在这里,我们集中讨论组蛋白 H3 的 PTM,它在染色质结构和基因表达的调控中发挥关键作用。组蛋白 H3 会被乙酰化、甲基化和磷酸化等大量 PTM 修饰。这些 PTM 发生在组蛋白 H3 的不同残基上,并能调节各种过程,包括胞核组织、染色质结构和染色质结合蛋白(称为“读取”蛋白)的募集。

赖氨酸残基的乙酰化受组蛋白赖氨酸乙酰转移酶 (HAT) 介导,并且会被组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 去除。组蛋白 H3 的乙酰化赖氨酸残基包括 Lys4、9、14、18、23、27、36 和 56。乙酰化会中和组蛋白 H3 上的正电荷,从而让结合 DNA 的蛋白更好地进入 DNA,并激活基因表达。此外,乙酰化赖氨酸残基会为含溴结构域和 YEAT 结构域的读取蛋白产生结合域。

组蛋白赖氨酸甲基化受赖氨酸甲基转移酶 (KMT) 介导,并且会被赖氨酸脱甲基酶 (KDM) 去除。组蛋白 H3 的甲基化赖氨酸残基包括 Lys4、9、27、36 和 79。每个赖氨酸残基可被单甲基化、二甲基化或三甲基化,并且每种甲基化状态似乎会发挥不同功能。甲基化不会影响组蛋白电荷,相反,它会调节读取蛋白与其有关蛋白复合体的结合。例如,多梳阻遏蛋白复合体 2 (PRC2) 三甲基化组蛋白 H3 Lys27 (H3K27me3) 会为 PRC1 复合体产生结合位点,其中两者均能产生对转录具有阻遏性的致密染色质。或者,H3K4me3 是一种结合多种转录激活读取蛋白的标记物。甲基化赖氨酸残基会为含染色质域、MBT 结构域、WD40 结构域和 PHD 指结构的读取蛋白提供结合域。

蛋白精氨酸甲基转移酶 (PRMT) 会单甲基化或二甲基化(对称或不对称地)精氨酸残基,包括 Arg 2、17 和 26,从而导致基因激活或抑制。此外,蛋白精氨酸脱氨酶 (PADI) 蛋白会将甲基化精氨酸残基转换为瓜氨酸。精氨酸残基的甲基化会为含 Tudor 结构域、PHD 指形结构和 WD40 结构域的读取蛋白产生结合位点。

最后,组蛋白 H3 在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基上被激酶磷酸化,并会被磷酸酶脱去磷酸。磷酸化残基倾向于聚集在组蛋白 H3 的氨基末端尾区,就像乙酰化一样,它会减少组蛋白的正电荷。此外,磷酸化残基会为含 14-3-3 结构域的读取蛋白产生结合位点,或为其他读取蛋白遮蔽结合位点(即 H3S10Phos 会阻断 HP1 染色质域蛋白与 H3K9Me3 的结合)。组蛋白 H3 Ser10 以及 Thr3、Thr11 和 Ser28 的磷酸化主要与有丝分裂和减数分裂期间的染色体凝缩有关。特别是,Ser10 的磷酸化常用作细胞有丝分裂的标记物。但 Ser10 和 Ser28 磷酸化还在转录激活中发挥轻微作用,尤其是在即早基因中。

主要文献:

非常感谢哈佛大学医学院麻省总医院的 Johnathan Whetstine 博士审阅本通路。

创建于 2018 年 3 月

  • 激酶激酶
  • 磷酸酶 磷酸酶
  • 转录因子转录因子
  • CaspaseCaspase
  • 受体受体
  • 酶
  • 促凋亡促凋亡
  • 促生存促生存
  • GAP/GEFGAP/GEF
  • GTP 酶GTP 酶
  • G 蛋白G 蛋白
  • 乙酰化酶乙酰化酶
  • 脱乙酰酶脱乙酰酶
  • 核糖体亚基核糖体亚基
  • 直接刺激修饰直接刺激修饰
  • 直接抑制修饰直接抑制修饰
  • 多级刺激修饰多级刺激修饰
  • 多级抑制修饰多级抑制修饰
  • 暂时性刺激修饰暂时性刺激修饰
  • 暂时性抑制修饰暂时性抑制修饰
  • 亚基或裂解活化产物的分离亚基或裂解活化产物的分离
  • 亚基结合亚基结合
  • 转位转位
  • 转录性刺激修饰转录性刺激修饰
  • 转录性抑制修饰转录性抑制修饰
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