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DH 蛋白结构域

凋亡:DH 结构域

小鼠 TIAM-1 的 DH 结构域。

结构域结合和功能

Dbl 同源 (DH) 或 RhoGEF 结构域包含一个约 150 个氨基酸的区域,该区域会诱导 Rho 家族 GTP 酶替换 GDP。通过结合 GTP,这会有效激活 Rho GTP 酶,GTP 酶在细胞中的含量高于 GDP。DH 结构域前方总是有一个普列克底物蛋白同源 (PH) 结构域。虽然 PH 结构域并非是催化核苷酸交换所必不可少的,但它似乎在许多情况下都能大大提高催化效率。Rho 蛋白调控肌动蛋白动力学、基因表达、膜转运、生长因子信号转导和细胞转化。编码 DH 结构域的蛋白 (RhoGEF) 可作为主要 Rho GTP 酶激活剂,也在这些活动中发挥作用。许多 RhoGEF 根据它们的转化活性被检测到,转化活性在 DH 结构域被破坏后会消失。

结构

DH 结构域由一个独一无二的延伸 α 螺旋束组成。这个螺旋束主要包含 CR1、CR2 和 CR3 区域,其中,每种形式都会将紧挤在一起的 α 螺旋分开。CR1 和 CR3 区域均为溶剂暴露区域,直至与 Rho GTP 酶形成复合体,并形成主要接触点。在 Tiam-1 的 DH 结构域结合 Rac-1 时,Rac-1 GTP 结合口袋内的转换 I 区被转移,并在 Tiam-1 内由 CR1 和 CR3 区域所形成的凹槽中结合。Rac-1 内的转换 II 区结合 DH 结构域的一个更大区域,导致 Rac-1 内的残基 59 和 64 被替换。这些变化的净影响在于:Mg2+ 离子配位至 GDP,并且结合 GDP 上的末端磷酸的 P 环被取代,随后致使 GDP 和 Rac-1 之间的结合变得不稳定。

结构参考

  1. Worthylake, T. et al. (2000) Nature 408, (6813), 682–688.

结构域蛋白示例

凋亡:DH 结构域

结合示例

DH 结构域蛋白 结合伴侣
Dbl RhoA/Rac1/Cdc42
p190 RhoGEF RhoA
Tiam-1 Rac1/Cdc42
p115 RhoGEF RhoA
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