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UBA 蛋白结构域

蛋白降解:UBA 结构域

HHR23A 的内部 UBA 结构域。

结构域结合和功能

泛素结合 (UBA) 结构域是一个约含 40 个氨基酸的基序,最初在与泛素化有关的蛋白中检测到,后来在与 DNA 核苷酸切除修复有关的蛋白中发现。UBA 结构域在体外结合单泛素、二泛素、三泛素和四泛素,但似乎高亲和力地结合聚泛素,表明聚泛素化蛋白是体内 UBA 结构域蛋白结合底物。许多 UBA 结构域会形成同型二聚体,并与其他底物发生异二聚化。在功能上,含 UBA 结构域的蛋白被认为会限制泛素链延伸,并靶向泛素化蛋白至 26S 蛋白酶体进行降解。

结构

NMR 数据表明,酵母 Rad23A (HHR23A) 的人同源物的 UBA 结构域会与疏水核心构成三螺旋束,疏水核心会与使蛋白变得稳定。这些结构域还有一个保守的疏水氨基酸保守表面小片段,其中氨基酸可能会与泛素和其他靶蛋白的疏水区域相互作用。

结构参考

  1. Mueller, T.D. and Feigon, J. (2002) J. Mol. Biol. 319 (5), 1243–1255.

结构域蛋白示例

蛋白降解:UBA 结构域

结合示例

UBA 结构域蛋白 结合伴侣
HHR23A 单泛素和聚泛素
Rad23(同源二聚化)
HHR23A(异源二聚化)
HIV Vpr
c-Cbl 未知
HIP-2 E2 泛素偶联酶 未知
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