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TUBBY 蛋白结构域

其他:TUBBY 结构域

结合 GPMI-p2(PI(4,5) P2 头基的类似物)的小鼠 tubby 的羧基末端结构域(红色)。

结构域结合和功能

TUBBY 结构域最初在 TUBBY 蛋白中被检测到,TUBBY 蛋白与成年发胖有关。双重结合的 TUBBY 结构域长约 260 个氨基酸,会与 DNA 和磷脂酰肌醇相互作用。TUBBY 和 TULP 蛋白的 TUBBY 结构域会高特异性地结合双重磷酸化的磷酸肌醇,磷酸肌醇在肌醇环的 4 位点被磷酸化(如 PI(4,5)P2)。这会让 TUBBY 结构域在 5HT2C 血清素受体等受体的下游发挥作用。5HT2C 激活会刺激激活磷脂酶 C (PLC) 的三聚 G 蛋白。PLC 水解 PI(4,5)P2 会让膜释放 TUBBY 结构域,从而实现胞核转位。一旦在胞核中,TUBBY 结构域结合 DNA,并且 TUBBY 蛋白氨基末端转录因子样激活结构域会促进转录。

结构

TUBBY 结构域会形成异常充满螺旋的 β 桶型结构。与 GPMI-P2(磷脂酰肌醇 (4,5) 二磷酸头基的一种类似物)构成复合体的 TUBBY 结构域共晶显示,在假定 DNA 结合凹槽的一个末端碱基口袋中会发生磷酸肌醇结合。与 GMPI-P2 相互作用所涉及的氨基酸侧链主要在 β 链 4、5 和 6 及螺旋 6A 中。结合界面的一个主要特征是赖氨酸-330,它在 4- 和 5 位点磷酸之间进行协调,并且对在肌醇环周围位点上被磷酸化的磷脂酰肌醇具有高特异性。

结构参考

  1. Santagata, S. et al. (2001), Science 292(5524), 2041–2050.

结构域蛋白示例

其他:TUBBY 结构域

结合示例

TUBBY 结构域蛋白 结合伴侣
Tubby PI(4,5)P2; PI(3,4)P2
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