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PUF (Pumilio) 蛋白结构域

其他:PUF (Pumilio)

结合 RNA(红色)的 Pumilio 的 PUF 结构域。

结构域结合和功能

PUF 蛋白家族在酵母、人和植物等生物中高度保守。所有 Pumilio/PUF 蛋白均包含一个羧基末端结构域,它含有八个带有氨基末端和羧基末端侧翼区域的重复序列亚基,被称为 Pumilio 同源结构域。Pumulio 重复序列蛋白会与靶标 mRNA 的 3' 未翻译区域发生序列特异性相互作用,以控制 mRNA 稳定性和翻译,从而调控发育的各个方面。这个结构域与 RNA 相互作用的亲和力和特异性取决于单独 Pumilio 亚基的重复使用,该亚基通过使用能够结合单独 RNA 碱基的三个保守氨基酸残基来结合 RNA 碱基。

结构

所示结构是含Pumilio (PUF) 结构域的蛋白 Pumilio1,它会与 RNA 构成复合体。8 个 pumilio 重复序列可通过蛋白的凹面结合 RNA。从结构上来说,这些结构域是类似于 Armadillo (ARM) 重复序列蛋白(β-catenin 和 karyopherin α)的 α 螺旋状重复序列蛋白。

结构参考

  1. Wang, X. et al. (2002) Cell 110(4), 501–512.

结构域蛋白示例

其他:PUF (Pumilio)
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