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PDZ 蛋白结构域

其他:PDZ 结构域

PSD-95 的第三个 PDZ 结构域。

结构域结合和功能

PDZ突触后致密蛋白 95 [PSD-85];Discs large [Dlg];紧密连接蛋白-1 [ZO-1])结构域是其中一个最常见到的结构域,包含大约 90 个氨基酸残基,它被发现是不同信号转导蛋白中的一个序列同源区域。PDZ 结构域可复制一份或多份,几乎可见于所有细胞浆蛋白中。PDZ 结构域包含 6 个 β-链和 2 个 α-螺旋,它们紧凑排列在一个球状结构中。与 PTB 和 PH 结构域相似,PDZ 结构域也缺少常见肽结合特异性,并且能与肽和脂质相互作用。目前有 4 类不同的 PDZ 相互作用:识别肽的羧基末端基序、识别肽的内部基序、PDZ-PDZ 二聚化和识别脂质。此外,会与羧基末端肽相互作用的 PDZ 结构域可根据它们的特异性分为 3 类。

结构参考

  1. Doyle, D.A. et al. (1996) Cell 85(7), 1067–1076.

结构域蛋白示例

其他:PDZ 结构域

结合示例

PDZ 结构域蛋白 结合伴侣 类型
PSD-95 NMDAR2A,B
Shaker K 类 + 通道
I 类:X-S 或 T-X-V
NHERF 或 EBP50 β2-肾上腺素受体 I 类:X-S 或 T-X-L
CASK Neurexin, Syndecan II 类:X-Ψ-X-Ψ
nNOS 褪黑素受体 III 类:X-D 或 E-X-Ψ
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