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PAS 蛋白结构域

其他:PAS 结构域

HIF-2α 的 PAS 结构域。

结构域结合和功能

PAS (Per ARNT Sim) 结构域最初在果蝇蛋白 PER 和 ARNT 中被发现,它是在所有物种生物体蛋白中都存在的模块。PAS 结构域发挥着重要作用,可作为氧张力、氧化还原电势或光强度的感受模块。在受到刺激时,该结构域会介导蛋白间相互作用,或结合其疏水核心中的辅因子,以调节蛋白间相互作用。在缺氧条件下,HIFα PAS-B 结构域会与 ARNT 的 PAS-B 发生异二聚化,其中,PAS-B 通过碱性螺旋-环-螺旋参与转录激活。丝氨酸/苏氨酸激酶 PASK 的 PAS 结构域可作为一个调节性感应蛋白,该蛋白具有一个会启动激酶活性调节开关的化合物和配体结合区域。

结构

PAS 结构域含有一个保守且缺少明显保守氨基酸序列的 α/β 折叠。PAS 常见折叠有多个 α 螺旋,螺旋侧有一个 5 链反向平行 β 片层,α 螺旋分配出一些残基,以形成位于 αA 周围的保守疏水核心的一部分。αA/αB 片段处的环对于配体结合很重要。

结构参考

  1. Erbel, P.J. et al. (2003) PNAS. 100(26), 15504–15509.
  2. Amezcua, C.A. et al. (2002) Structure 10, 1349–1361.

结构域蛋白示例

其他:PAS 结构域

结合示例

PAS 结构域蛋白 结合伴侣
HIFα  
ARNT (HIFβ)  
PASK  
HERG  
NCoA-1 STAT6, LXXLL
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