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GAT 蛋白结构域

泛素结合:GAT 结构域

人 GGA1 的 GAT 结构域。

结构域结合和功能

GGATom1 (GAT) 结构域与 GTP - ARF 相互作用,并且对膜募集 GGA 到反面高尔基体网络非常关键。氨基末端亚域对于 GAT 结合 GTP-ARF 非常重要,因为羧基末端亚域能结合泛素。GTP-ARF 的存在会增强 GAT 结构域与泛素的结合。GAT 结构域与含有同类三螺旋束的 SNARE 家族具有结构同源性,表明 GAT 结构域在膜融合中发挥作用。虽然 GGA1 和 GGA3 会与 ARF-GTP 和泛素相互作用,但 GAT 在 GGA2 和 Tom1 中的功能尚不清楚。

结构

N-GAT 亚域或钩状亚域包含一个螺旋-环-螺旋结构,在这个结构中,第二长的螺旋 α1 的一半氨基末端负责结合 ARF。C-GAT 亚域包含 3 螺旋束,后者由 α1、α2 和 α3 的一半氨基末端构成。GAT α3 螺旋一侧上的残基与泛素 Ile-44 表面碎片之间的相互作用会介导泛素结合。

结构参考

  1. Suer, S. et al. (2003) PNAS 100(8), 4451–4456.
  2. Shiba, T. et al. (2003) Nat. Struc. Biol. 10(5), 386–392.
  3. Shiba, Y. et al. (2004) JBC 279(8), 7105–7111.

结构域蛋白示例

泛素结合:GAT 结构域

结合示例

GAT 结构域蛋白 结合伴侣
GGA1 ARF1
GGA2 ARF3
GGA3 Rabaptin-5
Tom1  
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