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ChIP-seq 试剂盒性能比较

选择一种可检测正确靶标蛋白且不会非特异性结合其他 DNA 结合蛋白的抗体,这对进行成功的 ChIP-seq 实验很重要。现在,CST 可在 ChIP-seq 中检测和验证重组兔单克隆抗体,因为在 ChIP-qPCR 中的良好性能不一定就意味着抗体用于 ChIP-seq 的性能也好,因为 ChIP-seq 需要在大量基因位点中捕获更多靶标蛋白。我们经 ChIP-seq 验证的抗体已使用 SimpleChIP 酶解染色质免疫沉淀实验步骤和下一代测序分析 (NGS) 进行了检测。

使用 CST 生产的 ChIP-seq 抗体具有如下优势:

  • 所有 CST 经 ChIP-seq 验证的抗体均为重组兔单克隆抗体,可提供更佳的批间可重复性
  • 抗体已使用 SimpleChIP 酶解染色质免疫沉淀实验步骤进行了验证和优化,可节约您的时间和金钱
  • 抗体已在多种应用中进行了靶标特异性检测和验证,在 ChIP-seq 中的非特异性结合减弱,信噪比高
  • 抗体适用于其他 ChIP-seq 实验步骤,可用于 CST 或其他供应商提供的 ChIP 试剂盒以及定制实验室实验步骤
  • 开发和验证 ChIP-seq 抗体的科学家会提供专家技术支持

CST 还将我们的许多 ChIP-seq 抗体与其他公司经 ChIP-seq 验证的抗体进行了比较。单击以下任何 CST 抗体,查看我们的竞争优势。

  • NEBNext 是 New England Biolabs, Inc. 的注册商标。
  • Ultra 是 New England Biolabs, Inc. 的商标。
  • Illumina 是 Illumina, Inc 的注册商标。
  • BRD4 (E2A7X) Rabbit mAb #13440 与竞争公司的多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 MV-4-11 细胞的交联染色质与 7 μg BRD4 (E2A7X) Rabbit mAb #13440 或 7 μg 竞争公司的多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 5 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。全基因组分析(图 A)和局部基因分析(图 B)表明,与竞争公司的多克隆抗体相比,CST 的重组兔单克隆抗体产生的信号更强,背景更低。

    CTCF (D31H2) XP® Rabbit mAb #3418 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与 1 μg CTCF (D31H2) XP® Rabbit mAb #3418 或 1 μg 竞争公司的多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 5 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。全基因组分析(图 A)和局部基因分析(图 B)表明,与竞争公司的多克隆抗体相比,CST 的重组兔单克隆抗体产生的信号更强,背景更低。

    Ezh2 (D2C9) XP® Rabbit mAb #5246 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与 2 μg Ezh2 (D2C9) XP® Rabbit mAb #5246 或 2 μg 竞争公司的多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 5 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。局部基因分析表明,CST 重组兔单克隆抗体的信号和背景水平与竞争公司的多克隆抗体相当。

    Mono-Methyl-Histone H3 (Lys4) (D1A9) XP® Rabbit mAb #5326 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与 3 μg 经 ENCODE 验证的 Mono-Methyl-Histone H3 (Lys4) (D1A9) XP® Rabbit mAb #5326 或 3 μg 经 ENCODE 验证的竞争公司多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 50 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。局部基因分析表明,与经 ENCODE验证的竞争公司多克隆抗体相比,CST 的重组兔单克隆抗体产生的信号更强,背景水平低。

    Phospho-Rpb1 CTD (Ser2) (E1Z3G) Rabbit mAb (#13499) 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与 0.56 μg Phospho-Rpb1 CTD (Ser2) (E1Z3G) Rabbit mAb #13499、0.56 μg 经 ENCODE 验证的竞争公司的克隆 3E10 或 0.56 μg 竞争公司多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 5 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。全基因组分析(图 A)表明,与经 ENCODE 验证的竞争公司克隆 3E10 或竞争公司多克隆抗体相比,CST 的重组兔单克隆抗体的信噪比更高,并显示在其已知的靶基因 ZNF740(图 B)内结合 Rpb1。

    Phospho-Rpb1 CTD (Ser5) (D9N5I) Rabbit mAb #13523 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与0.35 μg Phospho-Rpb1 CTD (Ser5) (D9N5I) Rabbit mAb #13523、0.35 μg 竞争公司多克隆抗体 1 或 0.35μg 竞争公司多克隆抗体 2 进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 5 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。全基因组分析(图 A)和局部基因分析(图 B)表明,与竞争公司多克隆抗体 1 或 2 相比,CST 重组兔单克隆抗体的信号更强,背景更低。

    Rpb1 NTD (D8L4Y) Rabbit mAb #14958 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与 2 μg Rpb1 NTD (D8L4Y) Rabbit mAb #14958 或 2μg 竞争公司多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 5 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。全基因组分析(图 A)和局部基因分析(图 B)表明,与竞争公司的多克隆抗体相比,CST 的重组兔单克隆抗体产生的信号更强,背景更低。

    Tri-Methyl-Histone H3 (Lys9) (D4W1U) Rabbit mAb #13969 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 HeLa 细胞的交联染色质与 1.65 μg Tri-Methyl-Histone H3 (Lys9) (D4W1U) Rabbit mAb #13969、2 µg 经 ENCODE 验证的竞争公司多克隆抗体 1 或 2 μg 经 ENCODE 验证的竞争公司多克隆抗体 2 进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 50 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。局部基因分析表明,CST 的重组兔单克隆抗体的信号和背景水平与竞争公司多克隆抗体 1 或 2 相当。

    Tri-Methyl-Histone H3 (Lys27) (C36B11) Rabbit mAb #9733 与竞争公司多克隆抗体的并行比较。

    使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) #9005 对 4 x 106 个 NCCIT 细胞的交联染色质与 0.59 μg Tri-Methyl-Histone H3 (Lys27) (C36B11) Rabbit mAb #9733 或 2 μg 经 ENCODE 验证的竞争公司多克隆抗体进行 ChIP。使用 Illumina® NEBNext® Ultra II DNA Library Prep Kit 将 50 ng 富集的 ChIP DNA 制成 DNA 库,并在 Illumina NextSeq 上进行测序。局部基因分析表明,与经 ENCODE验证的竞争公司多克隆抗体相比,CST 的重组兔单克隆抗体产生的信号更强,背景水平低。

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