结合泛素的 Vps27 的 UIM 结构域（红色）。
泛素互作基序 (UIM) 首先发现是一个与 26S 蛋白酶体泛素结合 S5a 亚基同源的区域。该基序能结合单泛素以及聚泛素链，可见于与内吞和蛋白转运有关的许多蛋白。UIM 结合单泛素化底物可能会阻止后续泛素附着在泛素 Lys48 上，从而限制聚泛素链组装。有趣的是，多种含 UIM 结构域的蛋白自身会以一种依赖于 UIM 结构域的方式被泛素化。
UIM 结构域含有一个 α 螺旋，其中螺旋内的疏水残基会与泛素保守的 Leu8-Ile44-Val70 疏水小片段相互作用。UIM 内的酸性残基还会通过与泛素内碱性残基的相互作用来促进结合。
| UIM 结构域蛋白 | 结合伴侣 |
| HRS | 单泛素和聚泛素 |
| Epsin | 单泛素和聚泛素 |
| Eps15 | 单泛素和聚泛素 |