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概述

Akt 分子模型

下文列出了若干有助于您规划和执行实验的网络数据库和资源。这些网络数据库和资源包括抗体资源、蛋白质组工具、疾病数据库和突变数据库以及几个为信号转导研究提供实用工具的网站。

信号转导研究

Scansite scansite.mit.edu
Scansite 预测蛋白质内部的磷酸化位点和特定结构域结合区,MIT。
NetPhos 2.0 Server www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos
真核蛋白中磷酸化位点神经网络预测,丹麦技术大学。
Kinase.com www.kinase.com
来自人类、酵母、蠕虫和蝇类的蛋白激酶的分析。
AAAS | Science's STKE stke.sciencemag.org
信号转导知识环境:关于信号转导的资源和信息,科学杂志和斯坦福大学。需要订阅。
BIND——生物分子相互作用网络 bond.unleashedinformatics.com
生物分子相互作用网络数据库提供了蛋白质、核酸和小分子相互作用的完整描述。
BioCarta - Charting Pathways of Life www.biocarta.com/search/index.asp
“开源”资源,提供在线图,描绘了已选的信号转导通路。
细胞周期调节型酵母基因 genome-www.stanford.edu/cellcycle
识别其 mRNA 水平受细胞周期调控的酵母基因,斯坦福。
Horst Ibelgaufts’ COPE:细胞因子及细胞在线探索者百科全书 www.copewithcytokines.org
细胞因子及细胞百科全书,慕尼黑大学。
GPCRDB:G 蛋白偶联受体 (GPCR) 信息系统 www.gpcr.org/7tm
G 蛋白偶联受体信息系统。
NetOGlyc 3.1服务器 www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc
哺乳动物蛋白质中的 GalNAc O-糖基化位点预测,丹麦技术大学。
SenseLab senselab.med.yale.edu
合作努力,建立神经元和神经系统的一体化多学科模型,耶鲁大学。
生物信息学与生物计算 bip.weizmann.ac.il
对可能在常见疾病中发挥关键作用的‘热点分子’作了详尽注释,魏茨曼研究所。

在线链接网关

圣迭戈超级计算机中心:提供信息化基础设施 www.sdsc.edu
有关分子生物学和蛋白质组学工具和资源的优秀合集,圣迭戈加利福尼亚大学。
细胞和分子生物学在线 www.cellbio.com
细胞生物学和分子生物学信息资源。
TIGEM Telethon 遗传学和医学研究所 www.tigem.it
表达序列标签分析的资源链接,布雷西亚大学。

在线出版物和文献搜索引擎

Entrez PubMed www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed
NLM 提供的 MEDLINE 引文检索服务,含有在线期刊和其他相关数据库的链接,N.I.H。
PubCrawler 网络服务 pubcrawler.gen.tcd.ie/
免费“提醒”服务,浏览 NCBI、Medline 和 GenBank 数据库的每日更新。
公共科学图书馆 www.plos.org
致力于使世界科技和医学文献成为全世界的科学家和公众都能够免费获取的公共信息资源。

疾病和突变数据库

KinMutBase bioinf.uta.fi/KinMutBase
酪氨酸激酶结构域中致病突变数据库及通往其他突变数据库的链接,坦佩雷大学。
癌症染色体图集 atlasgeneticsoncology.org
肿瘤学和血液学中的遗传学和细胞遗传学图集,致力于癌症和癌倾向疾病的生物方面和分子方面。
OMIM——在线人类孟德尔遗传 www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=OMIM
在线人类孟德尔遗传:人类基因和遗传病分类,N.I.H。
人类基因突变数据库 (HGMD) www.hgmd.cf.ac.uk/ac/index.php
人类基因突变数据库,医学遗传学研究所,卡迪夫大学。
OMIM 基因座特异性突变数据库链接 www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/allresources.html#LocusSpecific
通往多个基因座特异性突变数据库的链接,N.I.H。
致病基因 www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/
按位置克隆的人类致病基因,N.I.H。
CGAP 合作 www.ncbi.nlm.nih.gov/ncicgap
癌症基因组剖析计划:致癌基因数据库,N.I.H。

基因剔除和转基因小鼠

JAX 小鼠数据库 jaxmice.jax.org/query/
转基因或具有靶向或化学诱导型突变的小鼠品系的来源,杰克逊实验室。

基因组数据库

TIGR 人类基因索引 compbio.dfci.harvard.edu/tgi/
TIG 人类基因索引。
Mitomap www.mitomap.org
人类线粒体基因组,埃默里大学。
MGI 3.3——小鼠基因组信息学 www.informatics.jax.org
小鼠基因组,杰克逊实验室。
伯克利果蝇基因组计划 www.fruitfly.org
果蝇基因组计划,伯克利。
桑格研究所:秀丽隐杆线虫计划 www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans
秀丽隐杆线虫基因组,桑格中心。
酵母属基因组数据库 www.yeastgenome.org
酿酒酵母基因组,斯坦福。
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