PTMScan® 技术 —— 免疫亲和富集并基于质谱分析的蛋白质组学

简化蛋白质组学漏斗

质谱分析技术可用于分析消化样品中翻译后修饰 (PTM) 肽。但是,PTM 肽经常呈现低丰度,这是研究人员在尝试使用质谱技术研究它们时要面临的一个难题。

为了解决这一难题,Cell Signaling Technology (CST™) 开发了 PTMScan® 技术,这是一种将含 PTM 肽的抗体富集与液相色谱-质谱联用技术 (LC-MS/MS) 相结合的专利蛋白质组学实验方法。PTMScan 技术能够识别与量化数百至数千的肽(即使是丰度最低的肽),并提供比其他方法(如 IMAC)更为集中的肽富集方法。

PTMScan 技术可用于:

  • 确定磷酸化、泛素化、酰化、甲基化或蛋白酶裂解的新蛋白质位点。
  • 识别并验证药物靶标。
  • 发现生物标记物。
  • 探索药物/化学调节物的作用机制。
  • 阐述药物脱靶效应。

用于 PTMScan® 技术的抗体

PTMScan 抗体

用于含有 PTM 肽富集的抗体是 PTMScan® 技术成功的关键。此类抗体:

  • 在公司内部设计和生产
  • 经过严格的特异性、灵敏度及一致性检测
  • 专门针对优化免疫亲和富集而配制

下表列出了用于 PTMScan 技术的三类抗体。

抗体类型 识别对象 示例
标准的位点特异性 PTM 抗体 在特定氨基酸序列的包围下已修饰的氨基酸。 针对丝氨酸 473 位点磷酸化的 Akt1 的 CST™ 抗体仅识别特定的磷酸化丝氨酸及周围的氨基酸。 标准的位点特异性 PTM 抗体序列
基序抗体 特定基序中的已修饰氨基酸。 Akt 底物基序抗体仅在丝氨酸残基被磷酸化时才能识别任何蛋白质中的序列 RXRXXS*(此时 X 可能为任何氨基酸)。 基序抗体序列
PTM 特异性抗体(PTM 抗体) 含目标 PTM 修饰的任何肽。 CST 乙酰化赖氨酸抗体可识别与侧链氨基酸序列无关的所有乙酰化位点。 PTM 特异性抗体(PTM 抗体)序列

PTMScan® Direct 与 PTMScan® Discovery

哪一项更适合您的研究?

PTMScan® Discovery
(基于 PTM/基序的富集)
PTMScan® Direct
(基于质谱分析的抗体芯片)
PTMScan Discovery PTMScan Direct
是否靶向特定通路?
是否进行抗体富集?
是否进行 LC-MS/MS?
使用哪种抗体? 针对不确定靶标的 PTM 或基序抗体。 针对已知感兴趣的通路的确定靶标的标准位点特异性抗体。
使用哪种形式的微珠? 在每个微珠上有针对一种 PTM 或基序的抗体。 在每个微珠上有针对多个靶标的抗体(基于微珠的多重分析)。
可用于哪些物种? 可用于多种不同物种的样本,包括但不限于人类、小鼠、大鼠、果蝇、拟南芥等。 经验证可用于人类和小鼠。(如需了解其他适用物种,请联系我们。)
案例研究 “使用新型抗乙酰化赖氨酸抗体和优化的蛋白质组学工作流程,对乙酰化组进行深度和量化覆盖。”
Svinkina, T., et al (2015) Mol.Cell.Proteomics 14(9):2429–40.
“PTMScan Direct:通过免疫亲和富集结合 LC-MS/MS 来识别和定量分析关键信号转导蛋白中的肽。”
Stokes, M., et al (2012) Mol Cell Proteomics.11(5):187–201.
总结 使用 PTMScan Discovery 可通过 PTM 定量分析获取新信息。 使用 PTMScan Direct 可定量分析各细胞系或处理对象间已知信号转导通路的组分活性。
Powered by Translations.com GlobalLink OneLink Software